Fils de Pie NDADAYE et de Thérèse BANDUSHUBWENGE, NDADAYE Melchior est né le 28 mars 1953 sur la colline Murama, dans la commune Nyabihanga, province Mwaro. Il était l’aîné de dix enfants.
De 1959 à 1966, il a fréquenté l’école primaire à Nyabihanga.
De 1966 à 1972, il a poursuivi son cursus scolaire à l’École Normale de Gitega. Il a dû interrompre ses études à la suite du génocide contre les Hutus en 1972. Il s’est réfugié au Rwanda, où il a parachevé ses études secondaires à Rilima.
En 1975, il entra à l’Université Nationale de Butare, Rwanda, Faculté des Sciences de l’Éducation qu’il termina avec brio.
De 1987 à 1992, il a suivi une formation bancaire à l’Institut des Techniques de Banque du Conservatoire national des arts et métiers, en France.
Sur le plan politique, NDADAYE Melchior fut le principal initiateur de BAMPERE (Ba=Barundi, M=Mouvement, P=Progressiste, E=Etudiant, R=Rwanda), le Mouvement des Étudiants Progressistes Barundi au Rwanda. En effet, NDADAYE Melchior et BACINONI Daniel, encore étudiants à Butare en 1975, ont pris l’initiative de contacter Jérôme NDIHO, membre du Mouvement des Etudiants Progressistes Barundi en Belgique (MEPROBA), qui était de passage à Butare. Lors de ce passage, ils l’ont rencontré là où il logeait chez Cyprien SINZOBAHAMVYA, ancien membre du MEPROBA et Professeur d’Economie à l’Université de Butare. Ils voulaient en savoir plus sur le MEPROBA, d’autant plus qu’ils lisaient régulièrement les publications de ce mouvement. Au terme d’un échange d’idées qui a duré toute l’après-midi, Jérôme NDIHO leur proposa de créer une section du MEPROBA au Rwanda comme il en existait en Belgique, en Union Soviétique (Russie), Allemagne, Italie, Tanzanie et en RD Congo (Lubumbashi et Kisangani). NDADAYE Melchior et BACINONI Daniel ont accepté. Ce fut le point de départ de la création d’un mouvement clandestin, BAMPERE.
Une fois de retour en Belgique, Jérôme NDIHO fut désavoué par le Comité Central du MEPROBA. Ce fut le début de malaise entre ce comité central et le BAMPERE en gestation.
Du côté de NDADAYE Melchior et BACINONI Daniel, le projet BAMPERE prospéra : il eut beaucoup de succès auprès des étudiants burundais (réfugiés) à l’Université de Butare.
Le 3 janvier 1976 marqua la date officielle de création de BAMPERE. Melchior NDADAYE en était membre dirigeant jusqu’en 1979. En 1978, BAMPERE, NDADAYE en tête, prit nettement ses distances par rapport au Comité Central du MEPROBA qui tentait d’assujettir BAMPERE alors que ce comité était réticent à l’idée de créer le parti UBU (Umugambwe w’abakozi b’Uburundi : le parti des travailleurs du Burundi) préconisé par BAMPERE, CPBR et la majeure partie du MEPROBA. CPBR (Cellules des Progressistes Burundais au Rwanda) était une organisation politique burundaise qui rassemblait les progressistes non étudiants au Rwanda. Notons que BAMPERE était encadré par le Docteur Isidore NKUNZUMWAMI, un ancien du MEPROBA qui était devenu membre de CPBR comme en était SINZOBAHAMVYA Cyprien.
Au début de 1979, CPBR et BAMPERE ont lancé un appel pour la création de l’UBU. Toutes les sections du MEPROBA ont soutenu CPBR et BAMPERE excepté une petite minorité du MEPROBA groupée autour du Comité Central du MEPROBA. Le parti UBU fut ainsi créé en août 1979. NDADAYE Melchior en était le chargé de l’Information et membre du Bureau Politique.
Notons que, les trois présidents du parti UBU qui se sont succédés, sont, par ordre chronologique, SINDIHEBURA Vénérant, BUYAGU Salvator et NTIBATINGESO Sévérin tous anciens du MEPROBA et du CPBR. Quant aux présidents de la République du Burundi, NDADAYE Melchior, Cyprien NTARYAMIRA et Sylvestre NTIBANTUNGANYA, ils furent tous membres du parti UBU après avoir été membres de BAMPERE. Tous les membres de l’UBU avaient l’obligation de militer dans la clandestinité sauf Jérôme NDIHO qui exerçait le mandat de Représentant de l’UBU partout où il pouvait arriver sur la planète.
Le 5 septembre 1983, NDADAYE Melchior quitta le Rwanda pour continuer la lutte clandestine au Burundi, d’abord dans le cadre de l’UBU puis au sein du FROLIDE qu’il a fondé à Gitega dans la clandestinité et qu’il a transformé en parti FRODEBU (Front pour la Démocratie au Burundi) en 1986. Le FRODEBU fut agréée en février 1991 et sortit de la clandestinité.
En plus des activités politiques ci-dessus, Ndadaye travailla au Centre Neurologique et Psychiatrique de Kamenge, Bujumbura. Il travailla ensuite comme cadre à la banque Meridian Bank.
Le 22 octobre 1988, NDADAYE Melchior fut arrêté puis jeté en prison à Rumonge par le Président Major BUYOYA pour avoir expliqué à sa manière la meilleure solution de sortir de la crise de Ntega et Marangara causée par cet ancien Président qui venait de se rendre coupable du massacre de plus de 50 000 citoyens, en utilisant le napalm notamment. En sa qualité de Premier Secrétaire de l’Union des Travailleurs du Burundi (UTB) dans la province de Gitega, NDADAYE Melchior avait exprimé, la veille, sa position à l’occasion d’une réunion de « pacification » organisée par le Gouverneur de Gitega à l’intention des fonctionnaires de cette province. Sa captivité dura trois mois.
Elu candidat du FRODEBU à l’élection présidentielle lors du Congrès Extraordinaire du 18 avril 1993, NDADAYE Melchior gagna les élections au premier tour le 1er juin 1993 avec 64,79 % des suffrages.
Trois mois plus tard, le 21 octobre 1993, le Premier Président de la République démocratiquement élu au Burundi, Son Excellence feu NDADAYE Melchior, fut assassiné à Bujumbura par l’Armée Burundaise sur ordre de ses plus hautes autorités militaires.